O Cerrado é um dos hotspots de conservação devido à elevada pressão que sofre. Nos últimos 35 anos mais de 50% da sua área foi transformada em agricultura e pastagens e apenas 2.2% de sua abrangência é composta por áreas protegidas. É a savana mais rica em flora do mundo, com mais de 7000 espécies e elevados níveis de endemismo para todos os grupos biológicos.

Apesar de ocupar 21% do território brasileiro e abrigar nascentes de diversas importantes bacias hidrográficas, o Cerrado não é um domínio fitogeográfico protegido por lei e por isso enfrenta extinções de espécies e degradação de seus habitats.